Vilkaviškio vyskupijos muziejus buvo įkurtas – 1992 03 13 KKC rektoriaus kun. Gracijaus Sakalausko. Muziejui vadovauti paskirtas Justinas Sajauskas.
Muziejus eigoje keitė pavadinimą: pradžioje vadinosi Religinės kultūros muziejumi, nuo 1995 m. – Bažnytinio meno muziejumi, Vyskupijos istorijos muziejumi, Vyskupijos istorijos ir meno muziejumi, Vilkaviškio vyskupijos muziejumi. Keitėsi ir muziejaus lokacija. Pradžioje jis buvo įkurtas Bažnyčios g. 23, Marijampolėje, vėliau perkeltas į Vytauto g. 25, Marijampolėje.
Eksponatus muziejui vyskupo įgaliojimu (pradžioje vysk. J. Žemaičio, vėliau vysk. R. Norvilos) rinko muziejaus direktorius Justinas Sajauskas iš Vilkaviškio vyskupijos bažnyčių, vienuolynų.
Muziejaus ekspozicijos atidarymas įvyko 1997 12 16. Atidaryme dalyvavo Lietuvos prezidentas Algirdas Brazauskas, Vilkaviškio vyskupas Juozas Žemaitis, Marijampolės miesto, rajono, apskrities vadovai. 1998 11 27 muziejuje apsilankė Lietuvos Prezidentas Valdas Adamkus.
Muziejaus ekspozicija veikė iki 2001 metų. Per tą laiką buvo paruoštos kelios parodos. Nuo 2002 m. iki dabar muziejaus ekspozicija nebuvo lankoma ir veikė kaip saugykla.
Nuo 2023 m. vasario mėnesio muziejui vadovauja muziejininkė Elena Gvazdaitienė. Per pastarąjį laikotarpį muziejaus ekspozicija buvo pertvarkyta, atnaujinta, pritaikyta pagal esamas sąlygas mokinių, piligrimų ar pavienių lankytojų nedidelių grupelių lankymui ( 10-12 asmenų).
Ekspozicija buvo įrengta savanorių talkininkų pagalba.
Muziejaus darbo laikas: I-IV 9:00-13:00 val.
Adresas: Vytauto g. 25, Marijampolė
Kviečiame aplankyti šį eksponatais turtingą, savanoriškais pagrindais laikomą muziejų.
